Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcolceQ61398 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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PcolceQ61398 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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PcolceQ61398 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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PcolceQ61398 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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PcolceQ61398 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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PcolceQ61398 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PcolceQ61398 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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