Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NinQ61043 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NinQ61043 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NinQ61043 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NinQ61043 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NinQ61043 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NinQ61043 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NinQ61043 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NinQ61043 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NinQ61043 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NinQ61043 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NinQ61043 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NinQ61043 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NinQ61043 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NinQ61043 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NinQ61043 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NinQ61043 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NinQ61043 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NinQ61043 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NinQ61043 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NinQ61043 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NinQ61043 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NinQ61043 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NinQ61043 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NinQ61043 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NinQ61043 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NinQ61043 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NinQ61043 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NinQ61043 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NinQ61043 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NinQ61043 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NinQ61043 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NinQ61043 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NinQ61043 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NinQ61043 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NinQ61043 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NinQ61043 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NinQ61043 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NinQ61043 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NinQ61043 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NinQ61043 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NinQ61043 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NinQ61043 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NinQ61043 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NinQ61043 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NinQ61043 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NinQ61043 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NinQ61043 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NinQ61043 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NinQ61043 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NinQ61043 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NinQ61043 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NinQ61043 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NinQ61043 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NinQ61043 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NinQ61043 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NinQ61043 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NinQ61043 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NinQ61043 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NinQ61043 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NinQ61043 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NinQ61043 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NinQ61043 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NinQ61043 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NinQ61043 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NinQ61043 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NinQ61043 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NinQ61043 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NinQ61043 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NinQ61043 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NinQ61043 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NinQ61043 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NinQ61043 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NinQ61043 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NinQ61043 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NinQ61043 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NinQ61043 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NinQ61043 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NinQ61043 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NinQ61043 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NinQ61043 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NinQ61043 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NinQ61043 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NinQ61043 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NinQ61043 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NinQ61043 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NinQ61043 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NinQ61043 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NinQ61043 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NinQ61043 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NinQ61043 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NinQ61043 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NinQ61043 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NinQ61043 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NinQ61043 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NinQ61043 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NinQ61043 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NinQ61043 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NinQ61043 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NinQ61043 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms