Protein–RNA interactions for Protein: Q60960

Kpna1, Importin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna1Q60960 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kpna1Q60960 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kpna1Q60960 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms