Protein–RNA interactions for Protein: Q60930

Vdac2, Voltage-dependent anion-selective channel protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac2Q60930 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vdac2Q60930 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vdac2Q60930 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vdac2Q60930 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vdac2Q60930 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vdac2Q60930 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vdac2Q60930 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vdac2Q60930 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vdac2Q60930 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vdac2Q60930 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vdac2Q60930 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vdac2Q60930 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vdac2Q60930 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vdac2Q60930 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vdac2Q60930 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vdac2Q60930 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vdac2Q60930 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vdac2Q60930 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vdac2Q60930 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vdac2Q60930 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vdac2Q60930 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vdac2Q60930 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vdac2Q60930 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vdac2Q60930 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vdac2Q60930 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vdac2Q60930 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vdac2Q60930 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vdac2Q60930 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vdac2Q60930 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vdac2Q60930 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vdac2Q60930 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vdac2Q60930 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vdac2Q60930 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vdac2Q60930 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vdac2Q60930 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms