Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DbpQ60925 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DbpQ60925 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DbpQ60925 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DbpQ60925 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DbpQ60925 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DbpQ60925 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
DbpQ60925 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DbpQ60925 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DbpQ60925 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms