Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkn2cQ60772 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms