Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Samhd1Q60710 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Samhd1Q60710 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Samhd1Q60710 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms