Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SkiQ60698 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SkiQ60698 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SkiQ60698 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SkiQ60698 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SkiQ60698 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SkiQ60698 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SkiQ60698 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SkiQ60698 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SkiQ60698 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SkiQ60698 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SkiQ60698 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SkiQ60698 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SkiQ60698 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SkiQ60698 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SkiQ60698 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SkiQ60698 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SkiQ60698 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SkiQ60698 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SkiQ60698 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SkiQ60698 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SkiQ60698 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SkiQ60698 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SkiQ60698 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SkiQ60698 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SkiQ60698 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SkiQ60698 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms