Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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PtprnQ60673 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprnQ60673 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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PtprnQ60673 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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PtprnQ60673 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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PtprnQ60673 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprnQ60673 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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PtprnQ60673 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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PtprnQ60673 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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PtprnQ60673 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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PtprnQ60673 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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PtprnQ60673 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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PtprnQ60673 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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PtprnQ60673 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtprnQ60673 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtprnQ60673 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtprnQ60673 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtprnQ60673 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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PtprnQ60673 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprnQ60673 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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PtprnQ60673 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprnQ60673 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
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PtprnQ60673 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprnQ60673 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprnQ60673 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprnQ60673 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms