Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sik1Q60670 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sik1Q60670 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms