Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nr2f1Q60632 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nr2f1Q60632 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms