Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZT7

Nkapl, NKAP-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkaplQ5SZT7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NkaplQ5SZT7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NkaplQ5SZT7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NkaplQ5SZT7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NkaplQ5SZT7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NkaplQ5SZT7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NkaplQ5SZT7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NkaplQ5SZT7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NkaplQ5SZT7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NkaplQ5SZT7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NkaplQ5SZT7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NkaplQ5SZT7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NkaplQ5SZT7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NkaplQ5SZT7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NkaplQ5SZT7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms