Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Specc1Q5SXY1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Specc1Q5SXY1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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