Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Brip1Q5SXJ3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brip1Q5SXJ3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms