Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Myh1Q5SX40 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Myh1Q5SX40 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Myh1Q5SX40 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms