Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSA0

Vmn1r223, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r223Q5SSA0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r223Q5SSA0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r223Q5SSA0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r223Q5SSA0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r223Q5SSA0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r223Q5SSA0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r223Q5SSA0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r223Q5SSA0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r223Q5SSA0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r223Q5SSA0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r223Q5SSA0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r223Q5SSA0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r223Q5SSA0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms