Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc88aQ5SNZ0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms