Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttf2Q5NC05 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttf2Q5NC05 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttf2Q5NC05 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms