Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp22Q5DU02 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp22Q5DU02 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms