Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKP2

Usp13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, mousemouse

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Length 858 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp13Q5BKP2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp13Q5BKP2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp13Q5BKP2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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