Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lrig2Q52KR2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lrig2Q52KR2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lrig2Q52KR2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lrig2Q52KR2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrig2Q52KR2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrig2Q52KR2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms