Protein–RNA interactions for Protein: Q505D7

Opa3, Optic atrophy 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa3Q505D7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opa3Q505D7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opa3Q505D7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Opa3Q505D7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opa3Q505D7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opa3Q505D7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opa3Q505D7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opa3Q505D7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opa3Q505D7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opa3Q505D7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms