Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA53

Pds5b, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pds5bQ4VA53 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Pds5bQ4VA53 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Pds5bQ4VA53 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Pds5bQ4VA53 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Pds5bQ4VA53 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Pds5bQ4VA53 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Pds5bQ4VA53 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Pds5bQ4VA53 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Pds5bQ4VA53 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Pds5bQ4VA53 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Pds5bQ4VA53 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Pds5bQ4VA53 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Pds5bQ4VA53 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
Pds5bQ4VA53 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Pds5bQ4VA53 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Pds5bQ4VA53 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Pds5bQ4VA53 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Pds5bQ4VA53 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Pds5bQ4VA53 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Pds5bQ4VA53 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Pds5bQ4VA53 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Pds5bQ4VA53 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
Pds5bQ4VA53 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Pds5bQ4VA53 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Pds5bQ4VA53 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Pds5bQ4VA53 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Pds5bQ4VA53 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Pds5bQ4VA53 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Pds5bQ4VA53 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Pds5bQ4VA53 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Pds5bQ4VA53 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Pds5bQ4VA53 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Pds5bQ4VA53 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Pds5bQ4VA53 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Pds5bQ4VA53 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Pds5bQ4VA53 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Pds5bQ4VA53 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Pds5bQ4VA53 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
Pds5bQ4VA53 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Pds5bQ4VA53 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Pds5bQ4VA53 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Pds5bQ4VA53 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Pds5bQ4VA53 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Pds5bQ4VA53 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Pds5bQ4VA53 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Pds5bQ4VA53 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Pds5bQ4VA53 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Pds5bQ4VA53 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Pds5bQ4VA53 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Pds5bQ4VA53 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
Pds5bQ4VA53 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Pds5bQ4VA53 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Pds5bQ4VA53 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Pds5bQ4VA53 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Pds5bQ4VA53 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Pds5bQ4VA53 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Pds5bQ4VA53 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Pds5bQ4VA53 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Pds5bQ4VA53 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Pds5bQ4VA53 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Pds5bQ4VA53 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Pds5bQ4VA53 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Pds5bQ4VA53 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Pds5bQ4VA53 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Pds5bQ4VA53 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Pds5bQ4VA53 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Pds5bQ4VA53 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Pds5bQ4VA53 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Pds5bQ4VA53 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Pds5bQ4VA53 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Pds5bQ4VA53 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Pds5bQ4VA53 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Pds5bQ4VA53 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Pds5bQ4VA53 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Pds5bQ4VA53 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Pds5bQ4VA53 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Pds5bQ4VA53 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Pds5bQ4VA53 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Pds5bQ4VA53 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Pds5bQ4VA53 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Pds5bQ4VA53 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Pds5bQ4VA53 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Pds5bQ4VA53 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
Pds5bQ4VA53 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Pds5bQ4VA53 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Pds5bQ4VA53 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Pds5bQ4VA53 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Pds5bQ4VA53 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Pds5bQ4VA53 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Pds5bQ4VA53 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Pds5bQ4VA53 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Pds5bQ4VA53 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Pds5bQ4VA53 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Pds5bQ4VA53 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Pds5bQ4VA53 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Pds5bQ4VA53 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Pds5bQ4VA53 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Pds5bQ4VA53 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Pds5bQ4VA53 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Pds5bQ4VA53 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms