Protein–RNA interactions for Protein: Q4V9W2

Srek1ip1, Protein SREK1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srek1ip1Q4V9W2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Srek1ip1Q4V9W2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srek1ip1Q4V9W2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srek1ip1Q4V9W2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srek1ip1Q4V9W2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srek1ip1Q4V9W2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srek1ip1Q4V9W2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srek1ip1Q4V9W2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srek1ip1Q4V9W2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms