Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZF3

Ddx49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx49Q4FZF3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ddx49Q4FZF3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx49Q4FZF3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ddx49Q4FZF3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms