Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
4933416C03RikQ3V063 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4933416C03RikQ3V063 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
4933416C03RikQ3V063 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
4933416C03RikQ3V063 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933416C03RikQ3V063 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933416C03RikQ3V063 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
4933416C03RikQ3V063 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933416C03RikQ3V063 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933416C03RikQ3V063 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933416C03RikQ3V063 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933416C03RikQ3V063 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933416C03RikQ3V063 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933416C03RikQ3V063 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933416C03RikQ3V063 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933416C03RikQ3V063 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933416C03RikQ3V063 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933416C03RikQ3V063 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933416C03RikQ3V063 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933416C03RikQ3V063 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933416C03RikQ3V063 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933416C03RikQ3V063 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933416C03RikQ3V063 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933416C03RikQ3V063 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933416C03RikQ3V063 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933416C03RikQ3V063 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933416C03RikQ3V063 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms