Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Kdm5aQ3UXZ9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Kdm5aQ3UXZ9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kdm5aQ3UXZ9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kdm5aQ3UXZ9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Kdm5aQ3UXZ9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kdm5aQ3UXZ9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kdm5aQ3UXZ9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kdm5aQ3UXZ9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kdm5aQ3UXZ9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kdm5aQ3UXZ9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm5aQ3UXZ9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm5aQ3UXZ9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm5aQ3UXZ9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm5aQ3UXZ9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm5aQ3UXZ9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm5aQ3UXZ9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm5aQ3UXZ9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm5aQ3UXZ9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm5aQ3UXZ9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm5aQ3UXZ9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm5aQ3UXZ9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm5aQ3UXZ9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm5aQ3UXZ9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm5aQ3UXZ9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm5aQ3UXZ9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm5aQ3UXZ9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm5aQ3UXZ9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5aQ3UXZ9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5aQ3UXZ9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5aQ3UXZ9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5aQ3UXZ9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5aQ3UXZ9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5aQ3UXZ9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5aQ3UXZ9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5aQ3UXZ9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm5aQ3UXZ9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms