Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUY6

Prom2, Prominin-2, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom2Q3UUY6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prom2Q3UUY6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prom2Q3UUY6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prom2Q3UUY6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prom2Q3UUY6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prom2Q3UUY6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prom2Q3UUY6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prom2Q3UUY6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prom2Q3UUY6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prom2Q3UUY6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prom2Q3UUY6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prom2Q3UUY6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Prom2Q3UUY6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prom2Q3UUY6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prom2Q3UUY6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prom2Q3UUY6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prom2Q3UUY6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prom2Q3UUY6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prom2Q3UUY6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prom2Q3UUY6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prom2Q3UUY6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prom2Q3UUY6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Prom2Q3UUY6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prom2Q3UUY6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prom2Q3UUY6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prom2Q3UUY6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prom2Q3UUY6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prom2Q3UUY6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prom2Q3UUY6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prom2Q3UUY6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prom2Q3UUY6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Prom2Q3UUY6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prom2Q3UUY6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prom2Q3UUY6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prom2Q3UUY6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prom2Q3UUY6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prom2Q3UUY6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prom2Q3UUY6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prom2Q3UUY6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prom2Q3UUY6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prom2Q3UUY6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prom2Q3UUY6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prom2Q3UUY6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prom2Q3UUY6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prom2Q3UUY6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prom2Q3UUY6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prom2Q3UUY6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Prom2Q3UUY6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prom2Q3UUY6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prom2Q3UUY6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prom2Q3UUY6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prom2Q3UUY6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prom2Q3UUY6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prom2Q3UUY6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms