Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Syndig1lQ3USQ7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syndig1lQ3USQ7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syndig1lQ3USQ7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms