Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl4Q3URY0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl4Q3URY0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms