Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms