Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPP8

Cep63, Centrosomal protein of 63 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep63Q3UPP8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cep63Q3UPP8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cep63Q3UPP8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cep63Q3UPP8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cep63Q3UPP8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cep63Q3UPP8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep63Q3UPP8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep63Q3UPP8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep63Q3UPP8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep63Q3UPP8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep63Q3UPP8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep63Q3UPP8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep63Q3UPP8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep63Q3UPP8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep63Q3UPP8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep63Q3UPP8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cep63Q3UPP8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cep63Q3UPP8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cep63Q3UPP8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cep63Q3UPP8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cep63Q3UPP8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cep63Q3UPP8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cep63Q3UPP8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cep63Q3UPP8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cep63Q3UPP8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cep63Q3UPP8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cep63Q3UPP8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cep63Q3UPP8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cep63Q3UPP8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cep63Q3UPP8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cep63Q3UPP8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cep63Q3UPP8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cep63Q3UPP8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cep63Q3UPP8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cep63Q3UPP8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cep63Q3UPP8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cep63Q3UPP8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms