Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Skap2Q3UND0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Skap2Q3UND0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms