Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem253Q3UNB8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem253Q3UNB8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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