Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cln5Q3UMW8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cln5Q3UMW8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms