Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cobll1Q3UMF0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cobll1Q3UMF0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms