Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMB9

Washc4, WASH complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc4Q3UMB9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Washc4Q3UMB9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Washc4Q3UMB9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Washc4Q3UMB9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Washc4Q3UMB9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Washc4Q3UMB9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Washc4Q3UMB9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Washc4Q3UMB9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Washc4Q3UMB9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Washc4Q3UMB9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Washc4Q3UMB9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Washc4Q3UMB9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Washc4Q3UMB9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Washc4Q3UMB9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Washc4Q3UMB9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Washc4Q3UMB9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Washc4Q3UMB9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Washc4Q3UMB9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Washc4Q3UMB9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Washc4Q3UMB9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Washc4Q3UMB9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Washc4Q3UMB9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Washc4Q3UMB9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Washc4Q3UMB9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Washc4Q3UMB9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Washc4Q3UMB9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Washc4Q3UMB9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Washc4Q3UMB9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms