Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcgf5Q3UK78 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcgf5Q3UK78 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms