Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sf3b2Q3UJB0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sf3b2Q3UJB0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sf3b2Q3UJB0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sf3b2Q3UJB0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sf3b2Q3UJB0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Sf3b2Q3UJB0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sf3b2Q3UJB0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sf3b2Q3UJB0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sf3b2Q3UJB0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sf3b2Q3UJB0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sf3b2Q3UJB0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sf3b2Q3UJB0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sf3b2Q3UJB0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sf3b2Q3UJB0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sf3b2Q3UJB0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sf3b2Q3UJB0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sf3b2Q3UJB0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sf3b2Q3UJB0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sf3b2Q3UJB0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sf3b2Q3UJB0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sf3b2Q3UJB0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sf3b2Q3UJB0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sf3b2Q3UJB0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Sf3b2Q3UJB0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sf3b2Q3UJB0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sf3b2Q3UJB0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sf3b2Q3UJB0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sf3b2Q3UJB0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sf3b2Q3UJB0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sf3b2Q3UJB0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sf3b2Q3UJB0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sf3b2Q3UJB0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sf3b2Q3UJB0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sf3b2Q3UJB0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sf3b2Q3UJB0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Sf3b2Q3UJB0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms