Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc34Q3UI66 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc34Q3UI66 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms