Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Greb1Q3UHK3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Greb1Q3UHK3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms