Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rsph3aQ3UFY4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rsph3aQ3UFY4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms