Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cops9Q3U898 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cops9Q3U898 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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