Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U595 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U595 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U595 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U595 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U595 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U595 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U595 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U595 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U595 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U595 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U595 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U595 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U595 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U595 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U595 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U595 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U595 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U595 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U595 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U595 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U595 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U595 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U595 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U595 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U595 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U595 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U595 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U595 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U595 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U595 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U595 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U595 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U595 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U595 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U595 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U595 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U595 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q3U595 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Q3U595 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Q3U595 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q3U595 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3U595 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3U595 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3U595 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3U595 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3U595 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3U595 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3U595 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3U595 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3U595 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3U595 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3U595 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3U595 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3U595 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3U595 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3U595 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U595 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U595 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U595 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U595 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U595 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U595 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U595 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U595 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U595 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U595 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U595 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U595 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U595 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U595 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U595 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U595 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U595 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U595 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U595 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U595 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U595 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U595 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U595 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U595 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U595 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U595 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U595 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U595 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U595 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U595 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U595 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U595 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U595 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3U595 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U595 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U595 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U595 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U595 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U595 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U595 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U595 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U595 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U595 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms