Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Palb2Q3U0P1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Palb2Q3U0P1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Palb2Q3U0P1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Palb2Q3U0P1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Palb2Q3U0P1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Palb2Q3U0P1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Palb2Q3U0P1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Palb2Q3U0P1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Palb2Q3U0P1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Palb2Q3U0P1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Palb2Q3U0P1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Palb2Q3U0P1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Palb2Q3U0P1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Palb2Q3U0P1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Palb2Q3U0P1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Palb2Q3U0P1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Palb2Q3U0P1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Palb2Q3U0P1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Palb2Q3U0P1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Palb2Q3U0P1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Palb2Q3U0P1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Palb2Q3U0P1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Palb2Q3U0P1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Palb2Q3U0P1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Palb2Q3U0P1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Palb2Q3U0P1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Palb2Q3U0P1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Palb2Q3U0P1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms