Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX3

Smyd5, SET and MYND domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd5Q3TYX3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Smyd5Q3TYX3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smyd5Q3TYX3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smyd5Q3TYX3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smyd5Q3TYX3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smyd5Q3TYX3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smyd5Q3TYX3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smyd5Q3TYX3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smyd5Q3TYX3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smyd5Q3TYX3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smyd5Q3TYX3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smyd5Q3TYX3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smyd5Q3TYX3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smyd5Q3TYX3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smyd5Q3TYX3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smyd5Q3TYX3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smyd5Q3TYX3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smyd5Q3TYX3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smyd5Q3TYX3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smyd5Q3TYX3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smyd5Q3TYX3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smyd5Q3TYX3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smyd5Q3TYX3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smyd5Q3TYX3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Smyd5Q3TYX3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smyd5Q3TYX3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smyd5Q3TYX3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smyd5Q3TYX3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smyd5Q3TYX3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smyd5Q3TYX3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smyd5Q3TYX3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smyd5Q3TYX3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smyd5Q3TYX3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smyd5Q3TYX3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smyd5Q3TYX3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smyd5Q3TYX3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smyd5Q3TYX3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smyd5Q3TYX3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smyd5Q3TYX3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Smyd5Q3TYX3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smyd5Q3TYX3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smyd5Q3TYX3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smyd5Q3TYX3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Smyd5Q3TYX3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smyd5Q3TYX3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smyd5Q3TYX3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smyd5Q3TYX3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms