Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ccdc136Q3TVA9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ccdc136Q3TVA9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ccdc136Q3TVA9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ccdc136Q3TVA9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Ccdc136Q3TVA9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ccdc136Q3TVA9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ccdc136Q3TVA9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ccdc136Q3TVA9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ccdc136Q3TVA9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ccdc136Q3TVA9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ccdc136Q3TVA9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ccdc136Q3TVA9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ccdc136Q3TVA9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ccdc136Q3TVA9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Ccdc136Q3TVA9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ccdc136Q3TVA9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ccdc136Q3TVA9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ccdc136Q3TVA9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ccdc136Q3TVA9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ccdc136Q3TVA9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ccdc136Q3TVA9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ccdc136Q3TVA9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ccdc136Q3TVA9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ccdc136Q3TVA9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ccdc136Q3TVA9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ccdc136Q3TVA9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ccdc136Q3TVA9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ccdc136Q3TVA9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ccdc136Q3TVA9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ccdc136Q3TVA9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ccdc136Q3TVA9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ccdc136Q3TVA9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ccdc136Q3TVA9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ccdc136Q3TVA9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ccdc136Q3TVA9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ccdc136Q3TVA9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ccdc136Q3TVA9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ccdc136Q3TVA9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ccdc136Q3TVA9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ccdc136Q3TVA9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Ccdc136Q3TVA9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Ccdc136Q3TVA9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ccdc136Q3TVA9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ccdc136Q3TVA9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ccdc136Q3TVA9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ccdc136Q3TVA9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ccdc136Q3TVA9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ccdc136Q3TVA9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ccdc136Q3TVA9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ccdc136Q3TVA9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ccdc136Q3TVA9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ccdc136Q3TVA9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ccdc136Q3TVA9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ccdc136Q3TVA9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ccdc136Q3TVA9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ccdc136Q3TVA9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ccdc136Q3TVA9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ccdc136Q3TVA9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ccdc136Q3TVA9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ccdc136Q3TVA9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ccdc136Q3TVA9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ccdc136Q3TVA9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ccdc136Q3TVA9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ccdc136Q3TVA9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ccdc136Q3TVA9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ccdc136Q3TVA9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ccdc136Q3TVA9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ccdc136Q3TVA9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ccdc136Q3TVA9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ccdc136Q3TVA9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ccdc136Q3TVA9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ccdc136Q3TVA9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ccdc136Q3TVA9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ccdc136Q3TVA9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ccdc136Q3TVA9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ccdc136Q3TVA9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ccdc136Q3TVA9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ccdc136Q3TVA9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ccdc136Q3TVA9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ccdc136Q3TVA9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ccdc136Q3TVA9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ccdc136Q3TVA9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ccdc136Q3TVA9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ccdc136Q3TVA9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ccdc136Q3TVA9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ccdc136Q3TVA9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ccdc136Q3TVA9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ccdc136Q3TVA9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ccdc136Q3TVA9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ccdc136Q3TVA9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ccdc136Q3TVA9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ccdc136Q3TVA9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ccdc136Q3TVA9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ccdc136Q3TVA9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ccdc136Q3TVA9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ccdc136Q3TVA9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ccdc136Q3TVA9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ccdc136Q3TVA9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ccdc136Q3TVA9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms