Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3TTL0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3TTL0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3TTL0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q3TTL0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3TTL0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3TTL0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3TTL0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q3TTL0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms