Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3TTJ4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3TTJ4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3TTJ4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3TTJ4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3TTJ4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms