Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf3c3Q3TMP1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms